Berikut ini disampaikan beberapa masalah yang sering dihadapi oleh peternak kenari dan cara – cara untuk mengatasinya :
| MASALAH | PENYEBAB | CARA MENGHATASI |
| Telur yang dihasilkan selalu gagal menetas, padahal terjadi perkawinan | Kemandulan, kegemukan, menu makanan dan minuman yang kurang baik | Ganti dengan kenari jantan dan betina lain dan ganti dengan menu makanan dengan baik |
| Telur yang dihasilkan tidak dapat optimal, tetapi hanya dua atau tiga butir. | Kemampuan kenari jantan dalam proses perkawinan kurang baik | Ganti dengan kenari jantan lain |